Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp5f1Q9CQQ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp5f1Q9CQQ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp5f1Q9CQQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp5f1Q9CQQ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.9 ms