Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE3

Mrps17, 28S ribosomal protein S17, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps17Q9CQE3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps17Q9CQE3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps17Q9CQE3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrps17Q9CQE3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrps17Q9CQE3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms