Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem223Q9CQE2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem223Q9CQE2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem223Q9CQE2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem223Q9CQE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem223Q9CQE2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem223Q9CQE2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms