Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SdhbQ9CQA3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SdhbQ9CQA3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhbQ9CQA3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdhbQ9CQA3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms