Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl49Q9CQ40 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl49Q9CQ40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms