Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms