Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
StambpQ9CQ26 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
StambpQ9CQ26 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms