Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atg3Q9CPX6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg3Q9CPX6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atg3Q9CPX6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg3Q9CPX6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg3Q9CPX6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms