Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb1Q9CPU1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb1Q9CPU1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb1Q9CPU1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssxb1Q9CPU1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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