Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms