Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GpnmbQ99P91 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GpnmbQ99P91 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms