Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nuf2Q99P69 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nuf2Q99P69 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nuf2Q99P69 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nuf2Q99P69 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms