Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atoh8Q99NA2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atoh8Q99NA2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atoh8Q99NA2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms