Protein–RNA interactions for Protein: Q99N42

Tymp, Thymidine phosphorylase, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TympQ99N42 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TympQ99N42 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TympQ99N42 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TympQ99N42 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TympQ99N42 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TympQ99N42 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TympQ99N42 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TympQ99N42 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TympQ99N42 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TympQ99N42 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TympQ99N42 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms