Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac9Q99N13 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac9Q99N13 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Hdac9Q99N13 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac9Q99N13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms