Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a6dQ99N07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a6dQ99N07 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ms4a6dQ99N07 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ms4a6dQ99N07 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ms4a6dQ99N07 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a6dQ99N07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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