Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt82Q99M74 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt82Q99M74 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt82Q99M74 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms