Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf34Q99KR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf34Q99KR6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf34Q99KR6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf34Q99KR6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms