Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa5aQ99KC8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa5aQ99KC8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa5aQ99KC8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa5aQ99KC8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa5aQ99KC8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms