Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfxn1Q99JR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfxn1Q99JR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfxn1Q99JR1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfxn1Q99JR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms