Protein–RNA interactions for Protein: Q99J93

Ifitm2, Interferon-induced transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm2Q99J93 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifitm2Q99J93 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifitm2Q99J93 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifitm2Q99J93 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifitm2Q99J93 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifitm2Q99J93 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm2Q99J93 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifitm2Q99J93 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm2Q99J93 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms