Protein–RNA interactions for Protein: Q99J55

Ier5l, Immediate early response gene 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5lQ99J55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ier5lQ99J55 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5lQ99J55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ier5lQ99J55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ier5lQ99J55 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ier5lQ99J55 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms