Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn16Q925N4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn16Q925N4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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