Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bbox1Q924Y0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bbox1Q924Y0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbox1Q924Y0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bbox1Q924Y0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms