Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nrif1Q923B3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrif1Q923B3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrif1Q923B3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms