Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim59Q922Y2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim59Q922Y2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim59Q922Y2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim59Q922Y2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim59Q922Y2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim59Q922Y2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim59Q922Y2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms