Protein–RNA interactions for Protein: Q921U8

Smtn, Smoothelin, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmtnQ921U8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SmtnQ921U8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmtnQ921U8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmtnQ921U8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SmtnQ921U8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms