Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sf3b3Q921M3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sf3b3Q921M3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sf3b3Q921M3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sf3b3Q921M3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms