Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt16hQ920B9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt16hQ920B9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt16hQ920B9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt16hQ920B9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms