Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Grin3bQ91ZU9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Grin3bQ91ZU9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Grin3bQ91ZU9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Grin3bQ91ZU9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Grin3bQ91ZU9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Grin3bQ91ZU9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,6 ms