Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atl3Q91YH5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atl3Q91YH5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atl3Q91YH5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms