Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps36Q91XD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps36Q91XD6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps36Q91XD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms