Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsx1Q91V10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsx1Q91V10 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vsx1Q91V10 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms