Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP3

Mical1, [F-actin]-monooxygenase MICAL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mical1Q8VDP3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mical1Q8VDP3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mical1Q8VDP3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mical1Q8VDP3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mical1Q8VDP3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms