Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc18Q8VD24 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zcchc18Q8VD24 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc18Q8VD24 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc18Q8VD24 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms