Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmprss4Q8VCA5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmprss4Q8VCA5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmprss4Q8VCA5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmprss4Q8VCA5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmprss4Q8VCA5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmprss4Q8VCA5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmprss4Q8VCA5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmprss4Q8VCA5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmprss4Q8VCA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms