Protein–RNA interactions for Protein: Q8R464

Cadm4, Cell adhesion molecule 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm4Q8R464 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cadm4Q8R464 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm4Q8R464 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cadm4Q8R464 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cadm4Q8R464 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cadm4Q8R464 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cadm4Q8R464 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cadm4Q8R464 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cadm4Q8R464 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cadm4Q8R464 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms