Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Z5

Cacnb1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb1Q8R3Z5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb1Q8R3Z5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb1Q8R3Z5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb1Q8R3Z5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacnb1Q8R3Z5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms