Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
0610009B22RikQ8R3W2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
0610009B22RikQ8R3W2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms