Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r200Q8R281 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r200Q8R281 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r200Q8R281 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r200Q8R281 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r200Q8R281 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms