Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0I4

Tm2d2, TM2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d2Q8R0I4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tm2d2Q8R0I4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm2d2Q8R0I4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d2Q8R0I4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d2Q8R0I4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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