Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Hecw1Q8K4P8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Hecw1Q8K4P8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Hecw1Q8K4P8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Hecw1Q8K4P8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Hecw1Q8K4P8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Hecw1Q8K4P8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33,78■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33,78■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33,77■■■■□ 3
Hecw1Q8K4P8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Hecw1Q8K4P8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Hecw1Q8K4P8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,57■■■□□ 2,97
Hecw1Q8K4P8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33,55■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Hecw1Q8K4P8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Hecw1Q8K4P8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Hecw1Q8K4P8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Hecw1Q8K4P8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Hecw1Q8K4P8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Hecw1Q8K4P8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Hecw1Q8K4P8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,6 ms