Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Abca9Q8K449 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abca9Q8K449 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abca9Q8K449 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Abca9Q8K449 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abca9Q8K449 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abca9Q8K449 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms