Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufs8Q8K3J1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.2 ms