Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txndc11Q8K2W3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txndc11Q8K2W3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Txndc11Q8K2W3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Txndc11Q8K2W3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms