Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Depp1Q8K2F3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Depp1Q8K2F3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Depp1Q8K2F3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms