Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1C9

Lrrc41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc41Q8K1C9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc41Q8K1C9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc41Q8K1C9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc41Q8K1C9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc41Q8K1C9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms