Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf628Q8CJ78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf628Q8CJ78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf628Q8CJ78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms