Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clip4Q8CI96 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip4Q8CI96 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clip4Q8CI96 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clip4Q8CI96 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms