Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rftn2Q8CHX7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn2Q8CHX7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn2Q8CHX7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms