Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGD2

Crispld1, Cysteine-rich secretory protein LCCL domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crispld1Q8CGD2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crispld1Q8CGD2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crispld1Q8CGD2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crispld1Q8CGD2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms